Majka mu je bila Kušina Uzumaki, a otac četvrti hokage Minato Namikaze. Odmah posle Narutovog rođenja selo Konohu napao je Kjubi, demonska devetorepa lisica. Ona je terorisala selo i skoro ga uništila. Mnoge je usmrtila. Sa lisicom se izborio četvrti hokage uz pomoć samoning džucua (tehnika prizivanja).^[1]

Prizvao je Gamabuntu kako bi porazio Kjubija, a posle toga iskoristio smrtonosni pečat i zaključao lisicu u dečaka žrtvujući svoj život. Znajući da će stanovnici Konohe mrzeti Naruta jer u sebi nosi Kjubija, četvrti hokage je rekao prethodnom, Sarutobiju, da prenese seljanima da moraju poštovati Naruta i prihvatiti ga kao jednakog, jer je on poslužio kao biće u koje je zaključana lisica i posredno učestvovao u spašavanju sela. ^[1]

Međutim, kako su svi znali istinu o Narutu, izbegavali se ha jer su se plašili, dok su ga druga deca ismevala. Ipak, kasnije su ga svi prihvatili kao jednog od njih. Iruka Umino je prva osoba koja veruje i ima poverenja u Naruta.

Stanje se menja od trenutka kada Naruto postane cenjeniji. Svoju reputaciju je poboljšao borbom sa Pejnom (Nagatom) koji je potpuno razorio selo. Naruto pobeđuje i postaje heroj. On igra važnu ulogu u četvrtom nindža ratu- gde su samo on i džinčuriki osmorepog bika potrebni za izvođenje gendžucua Beskonačni tsukujomi (Infinite tsukuyomi) u planu Učiha Madare i Obita da pretvore život u jedan veliki san i samim tim unište svet i realnost. U ratu Naruto otključava moć šest puteva (Six paths), koristi svoj sendžucu, Saske se vraća u Konohu i staje na njenu stranu protiv Akacukija i zajedno se bore protiv Madare i Kaguje (Prve osobe koja je ikada posedovala čakru, poznavalac svakog džucua). Saske dobija rinegan .Gaj sensej upotrebljava svoj džucu u borbi sa Madarom. Nedži biva ubijen. Saske otkriva da ima nameru da postane hokage (koja nije tako prihvaćena, Kiba kaže da Akamaru ima veće šanse od njega) . Posle rata Naruto biva proglašen za narodnog heroja, Kakaši Hatake postaje šesti hokage, a ubrzo zatim i Naruto postaje sedmi hokage.

Naruto je venčan sa Hinatom Hjugom i imaju dvoje dece- Boruta (Munju) i Himavari. U "Gaiden" serijalu mange- Naruto ima trideset i četiri godine. Saske odlazi na dug put oko sveta posle svoje ženidbe sa Sakurom i rođenja svoje ćerke Sarade (koja poseduje šaringan). Naruto sada ima otključane- moć kjubija (Kurame), moć svih repatih čudovišta (preostalih osam), moć šest puteva (šest gudoudama) i selo peska i selo skriveno među lišćem (Konohagakure) su sada povezani, kao i njihovi kagei Kazekage sama -Gaara i Hokage sama-Naruto. Selo skriveno među lišćem sada više nije selo nego grad usled napredovanja tehnologije i Narutove vladavine.